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mRNA 疫苗

早在針對(duì) SARS-CoV-2 的 mRNA 疫苗將這項(xiàng)技術(shù)推向舞臺(tái)中央之前,mRNA 就已被確定為是一種潛在的抗腫瘤疫苗接種方法,而現(xiàn)在,鑒于COVID-19疫苗的巨大成功,mRNA已被探索用于其它各種領(lǐng)域,包括針對(duì)其它傳染病的疫苗、抗腫瘤疫苗以及蛋白質(zhì)補(bǔ)充/替代療法等。盡管mRNA對(duì)幾乎無處不在的核糖核酸酶敏感并且可能會(huì)快速降解,但其同樣具有強(qiáng)大的安全性優(yōu)勢(shì),非復(fù)制意味著它不與基因組相互作用,而其相對(duì)不穩(wěn)定性和體內(nèi)快速代謝清除可以通過使用各種修飾來調(diào)節(jié)?,F(xiàn)有的成功經(jīng)驗(yàn)已經(jīng)證實(shí),將mRNA制劑到不同的載體結(jié)構(gòu)中后,可實(shí)現(xiàn)給藥后的快速攝取和高效蛋白質(zhì)表達(dá)。

 

完整的 mRNA 生產(chǎn)過程面臨多方面的挑戰(zhàn),包括與起始物料(質(zhì)粒DNA,pDNA)相關(guān)的挑戰(zhàn),以及mRNA自身的特殊屬性相關(guān)所帶來的挑戰(zhàn),如其對(duì)幾乎無處不在的核糖核酸酶的高度敏感性、對(duì)工藝過程產(chǎn)生中的剪切的高度敏感性,以及由于mRNA與某些雜質(zhì)(如雙鏈 RNA 或 dsRNA)的大小相似而導(dǎo)致的分離純化挑戰(zhàn)。在獲得所需目的序列的pDNA模板之后,mRNA的無細(xì)胞下游生產(chǎn)步驟可以概括為:

 

? 在稱為體外轉(zhuǎn)錄 (IVT) 的酶促反應(yīng)過程中合成mRNA,即將目標(biāo) DNA 序列的模板 – 線性化pDNA、核苷酸 (NTP) 以及酶混合在一起。

? 然后使用層析、切向流過濾和除菌過濾等步驟,從反應(yīng)混合物/污染物中得到純化轉(zhuǎn)錄 mRNA。

? 最后將 mRNA 封裝在一般由4種脂質(zhì)成分組成的脂質(zhì)納米顆粒(LNP)中,最終產(chǎn)品在無菌灌裝之前使用切向流過濾 (TFF) 和/或?qū)游鲞M(jìn)行純化及濃縮。

 

mRNA 疫苗

 

生產(chǎn) mRNA 的挑戰(zhàn)

 

mRNA的合成

 

mRNA 的無細(xì)胞合成需要 pDNA 模板被限制酶線性化,該酶將在超螺旋質(zhì)粒的特定部分進(jìn)行切割。需要去除與此步驟相關(guān)的雜質(zhì),如使用切向流過濾和/或?qū)游?。然后,將線性化的 DNA 模板在體外轉(zhuǎn)錄(IVT)成 mRNA。將 RNA 聚合酶(如T7 RNA聚合酶)和三磷酸核苷酸添加到線性化且純化的 pDNA 中。為了增加 mRNA 的穩(wěn)定性和/或降低免疫原性,可以使用一些修飾的三磷酸核苷酸。當(dāng)然,這種策略的商業(yè)化應(yīng)用需要考慮到專利保護(hù)的問題。為了穩(wěn)定并允許在細(xì)胞中進(jìn)行有效的 mRNA 轉(zhuǎn)導(dǎo),需要 3' poly-(A) 尾和 5' 帽。 Poly-(A) 尾對(duì)于終止蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)錄和翻譯至關(guān)重要,它可以防止 3' 核酸外切酶消化 mRNA。 5' 帽通過防止 5' 核酸外切酶降解來穩(wěn)定 mRNA??梢允褂脙煞N方法來給 mRNA 加帽。加帽可以發(fā)生在轉(zhuǎn)錄步驟中,或者,可以在 IVT 后,使用牛痘病毒加帽酶,以酶促方式實(shí)現(xiàn)加帽,后者通常加帽效率更高,但需要先純化 mRNA。

 

mRNA的純化

 

在 IVT 之后,轉(zhuǎn)錄的 3’poly-(A)-mRNA-5'帽產(chǎn)物需要從可能存在內(nèi)毒素、免疫原性 dsRNA、殘留 DNA 模板、RNA 聚合酶、截短的 RNA 片段、未使用的三磷酸核苷酸和加帽反應(yīng)過程中產(chǎn)生的其它雜質(zhì)的混合物中純化。有多種選項(xiàng)可用于 mRNA 的純化,通常包括一或兩步的層析步驟,以及基于切向流過濾的超濾/洗濾步驟。

 

親和層析是常用的高效純化策略,如Poly (dT) 層析,其通過捕獲帶 poly-A 尾的 mRNA,有效去除 DNA、核苷酸、酶、緩沖液成分等不帶 poly-(A) 尾的雜質(zhì),但不能將 dsRNA 與單鏈RNA (ssRNA) 區(qū)分開來。初始親和層析之后,通常是第二個(gè)層析步驟,稱為精純步驟,以進(jìn)一步純化 ssRNA,例如使用陰離子交換層析。有時(shí),也會(huì)結(jié)合使用離子交換和疏水作用層析。

 

使用截留分子量范圍為 30 至 300 kDa 的切向流過濾是將 mRNA 與較小的雜質(zhì)進(jìn)行分離的替代性方式,使用切向流過濾也可在同一單元操作中進(jìn)行濃縮和洗濾換液。

 

在標(biāo)準(zhǔn)批次模式 IVT 工藝中,在反應(yīng)完成后從反應(yīng)混合物中純化所需的 RNA 產(chǎn)物,而聚合酶、pDNA 模板和未反應(yīng)的三磷酸核苷被丟棄。但由于這些 IVT 反應(yīng)組分價(jià)格昂貴,已經(jīng)有開發(fā)人員嘗試使用類似補(bǔ)料分批的轉(zhuǎn)錄策略來進(jìn)行大規(guī)模 mRNA 生產(chǎn),過程中,監(jiān)測 IVT 反應(yīng)的進(jìn)程,以保持最佳反應(yīng)條件,并在反應(yīng)過程中,將組分按需添加到反應(yīng)器中。獲得完整的全長 RNA 產(chǎn)物的效率,或出現(xiàn)截短的轉(zhuǎn)錄物的幾率,取決于 RNA 序列和反應(yīng)條件的精確控制,需要優(yōu)化,以提高工藝產(chǎn)量。

 

封裝 mRNA

 

RNA 對(duì)到處存在的核糖核酸酶的快速降解高度敏感,這就需要一個(gè)有效的系統(tǒng),不僅可以穩(wěn)定 mRNA,還可以將 mRNA 引入細(xì)胞。 mRNA 與遞送系統(tǒng)的混合、以及各種脂質(zhì)聚合物成分的選擇組合,已被證明可以保護(hù) mRNA 免受核糖核酸酶降解,增強(qiáng)細(xì)胞攝取,并改善在靶細(xì)胞中的 mRNA 翻譯。

 

脂質(zhì)納米顆粒 (LNP) 是最常用的 mRNA 遞送系統(tǒng);其通常由4種不同的脂質(zhì)成分組成,包括可電離陽離子脂質(zhì)、輔助融合磷脂、膽固醇以及聚乙二醇(PEG)-脂質(zhì)。將mRNA 封裝在脂質(zhì)復(fù)合物中,可使其免受核糖核酸酶降解,同時(shí)將其有效地遞送到細(xì)胞的細(xì)胞質(zhì)中。

 

LNP 制備的第一個(gè)步驟是將脂質(zhì)溶解在溶劑(例如乙醇)中,然后使用錯(cuò)流或微流體混合器將溶解的脂質(zhì)與含有mRNA 的低 pH 值水性緩沖液快速混合,以獲得包封mRNA的LNP,對(duì)混合流道、速度等的優(yōu)化控制是獲得所需粒徑大小、粒徑分布以及包封效率等特性的關(guān)鍵。對(duì)產(chǎn)生的 mRNA-LNP 復(fù)合物進(jìn)行洗濾,以用中性緩沖液代替低 pH 緩沖液。此步驟應(yīng)快速進(jìn)行,以避免在低 pH 值下觀察到的脂質(zhì)降解。然后通過超濾方法進(jìn)行濃縮。

 

LNP 的缺點(diǎn)包括它們可能需要冷鏈物流。此外,鑒于LNP的粒徑,并不總是可以對(duì)其進(jìn)行除菌過濾,在這種情況下,必須考慮替代方案,例如采用完全一次性的封閉式工藝。

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